
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸掩盖球蛋白组学产品,实现1000+玄之又玄度掩盖位点查出,固定逆转原素靶点,全方向位置生信数据分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“看到”到“确认”全步奏服务质量,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、实践过程
02、测评的数据
03、经“点”再次出现
在场地实测参数中,检测另一两个期刊论文中媒体报道的非常经典靶点非常衣康酸淡化位点,如首先个被挖掘的衣康酸共价淡化血清KEAP1,还糖酵解通道中的3个要素酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,并且炎性小体组合血清NLRP3和组织挫裂时中的要素血清RIPK3等,其质谱图如表图如图。
04、货品特征
1.多个质控
房地产业化特情人判断器孵育、SDS-PAGE判断、WB印证、样品相关的性定性分析等相互位判断,确保安全生产项目流程最后安全可靠性性。2.高稳定性质谱实验仪器系统
在Orbitrap Astral全新这一代高辩认质谱仪支持下,变现衣康碱化呈现位点及淀粉酶鉴定结论新深度的,推助专业科研探索与发现。3.全步奏一趟式服務
源于拜谱生物体完美的實驗品台,可提供了“细胞系培育→检查器孵育→WB检查→什么难以理解的度衣康硝化作用掩盖检查→专有生信讲解→指定位点PRM安全验证”全步骤服务项目,省时干净省心呢更干净省心。05、了解网站内容(位置)
06、软件位置
PART 2、文章分享视频
期刊论文一
英文翻译一级标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
中文翻译主题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
设计东西:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
文献资料二
英文怎么说微信标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
中文名字问题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
研究方案主要内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、典例双重性思维
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13兼备极强的底物组合技能,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱生物工程衣康碱化表达组测量数据统计中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康碱化突显(给出图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱总结
充当TCA不断循环中的后面基础产生物,衣康酸调准基础产生、抗体和慢性妇科的疾病互不之间的互不能力,为缓解抗体慢性妇科的疾病性妇科的疾病出具了充当缓解机制。衣康酸节构中的亲电性α,β-不饱和点羧酸节构能对蛋清质上的活性酶半胱氨酸残基完成烷基化装饰(迈克尔增加现象),这种译成后装饰被称是“衣康酸装饰(itaconation)”,行而引响蛋清质功能表,调节管控抗体回复和基础产生行业,为多种类妇科的疾病类药物研发管理出具新方法。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸掩盖蛋白酶组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物临床医学根本化学发光法靶向疗法分解组(QMT1000)或能量消耗细胞代谢率靶点细胞代谢率组物品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
参考价值学术论文
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.