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Microb Cell Fact | 遵义医科大学冯昆团队揭示无柄灵芝培养物产生灵芝酸的机制

发布时间：2024-07-25

三萜类化合物已提示出宽泛的菌物生物，是指抗肺部肿瘤和抗病性毒反应。普通，三萜是实现甲羟戊酸方法提炼的，并从绿色藤本植物和真菌感染中截取。遵义医科大学冯昆团队在Microb Cell Fact（IF=6.4）上投稿了一篇“Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile”的研究分析方案职称论文。该研究分析方案会发现三萜类氧化物虫草酸（GA）是实现气体致力于的无柄虫草菌丝体中二萜15,16-二氢丹参酮I（DHT）的微生物工程有效的转化行成了的。经过转录组和淀粉酶质组学高技巧进三步科学探索无柄虫草粉菌丝体中DHT行成了两个虫草粉酸（GA）的机制化，并随着几组学高技巧检查到的的距离基因遗传和的距离淀粉酶，预测出DHT 微生物工程转化成 GA 的方式。拜谱生物提供了转录组测序和TMT定量蛋白质组学技术，为研究二萜生物转化为三萜提供了丰富的组学信息和候选基因。

文章名称：Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile（Microb Cell Fact，IF=6.4，2023.7）

客户单位：遵义医科大学

研究材料：无柄灵芝真菌菌丝体

拜谱提供技术：转录组测序、TMT定量蛋白质组学

研究结果

1.转录类物质析和功效类型

利用对无柄虫草真菌感染菌丝体做好转录组测序共取到67230个转录本和14299个单DNA。在这样的单DNA中，492被检测为一定的差异表述DNA（DEGs），中间213个表述调整，279个表述调低（图1A）。GO含有研究后，DEGs氛围生态学期间（BP）、组织有效成分（CC）和大分子职能（MF）3类。在BP门类中，发生了前5个子门类：四环素溶解新陈消化吸收转化转化期间，乙酸盐新陈消化吸收转化转化期间和甲酸盐新陈消化吸收转化转化期间;而在CC门类中，组织外区、突触复合型体、突触格局是前5个亚类。对MF门类，甲酸脱氢酶（NAD）特异性、防氧化恢复原酶特异性和酸氨（或酰胺）链接酶特异性是前5个亚门类（图1B）。在DEGs的KEGG环路研究中，前30条含有度是最高的的环路中含27条是一种新陈消化吸收转化转化，中间甲烷气体新陈消化吸收转化转化、乙醛酸盐和二羧酸盐新陈消化吸收转化转化、丙酸盐新陈消化吸收转化转化无线信号环路差异性含有（图1D）。

图1|转录混合物析和效果几大类

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

2. 蛋白质组定量分析和功能分类

实现对无柄灵芝粉念珠菌菌丝体实现营养素质组学定性研究，共设选择了16,457种有趣肽、2606种营养素质和2588种降钙素原检测营养素质。在阀值|FC|>1.2和p<0.05的挑选必要条件下，于这2606种营养素质中，94种被签定为之间的关系理解营养素（DEPs），当中52种调整，42种变动（图2A），图2C显视了之间的关系理解营养素的聚类研究法定性研究热图。从GO定性研究你看，BP品目显视，大部份数DEPs体验乙酸盐排泄操作期间、四环素转化排泄操作期间和制剂转化排泄操作期间。CC类DEPs在細胞外区、过腐蚀物酶体和微体中覆盖率最低，腐蚀还原故宫场景酶吸附性和甲酸脱氢酶（NAD）吸附性在MF类中DEPs的比例表最低（图2B）。与转录组效果是类似的，KEGG通道定性研究显视，多个DEPs在排泄中含有，当中3条最含有的方法是光合生态学工程中的碳紧固、碳排泄和MAPK走势通道（图2D）。前者，实现定性研究GO数据显示库的CC对DEPs实现亚細胞定位功能定性研究和注脚（图2E），DEPs其关键匀称在細胞质（40.66%）、細胞膜（17.58%）、线粒体（12.09%）和内质网（8.79%），系统理论上是GAs生态学工程提炼的其关键地理位置。

图2|核营养素组的降钙素原检测数据分析和的功能验正

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

3.转录组和蛋白质组数据相关性分析，RT-qPCR验证

营生物生成和对应组获选DEGs和DEPs生产了维恩图，有20个文化差异表述出来DNA（图3A）。对转录组和营养素质组中E组和C组有的DEGs/DEPs做聚类进行讲解进行讲解，遇到mRNA和营养素质相互间有18个上涨DNA和8个变动DNA，DEGs两者英译的DEPs表述出来能力呈正有关于，特征提取Pearson的有关于指数公式进行讲解，在转录组和营养素质组相互间检则到相对的较高的有关于性（R = 0.87）（图3C）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）测量成果展示，E组和C组1个DEGs的传达能力对比正相关，这当中9个为上涨DEGs，4个为再降DEGs（图3D）。DEGs在RT-qPCR中的传达发展趋势与转录多组分析成果相符。

图3|球高蛋白组的化学发光法浅析和的功能证实

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

拜谱小结

综上所述，该研究结果为真菌对天然产物的生物转化提供了新的见解，这将有助于开发更有效、更经济的方法，以方便的方式获得稀有的三萜。拜谱生物提供了转录组测序、TMT定量蛋白质组学转录组学技术，拜谱生物可提供完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系。此外，拜谱生物推出的中药代谢组整体解决方案，基于更丰富、更专业的中药数据库，更高的数据质量、更优质的服务，可进行中药成分分析、中药入血/组织分析、网络药理学等分析，助力客户探索中药前言研究，欢迎致电咨询！

参考文献：Wang X, Wu H, Wong KH, Wang Y, Chen B, Feng K. Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile. Microb Cell Fact. 2023 Jul 28;22(1):139. doi: 10.1186/s12934-023-02156-5.

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